version 0.3.1 β

  • [Everything Clean Geometry] [Everything Clean Geometry Water]ボタンを追加しました。PDB / mol2 / sdf / mol ファイルを読み込んだときに、読み込んだ全分子系のClean Geometry  (エネルギー最小化計算による構造最適化、いわゆる、構造のひずみを取る計算) を数回のクリックで、ほぼ全自動で完了させます。
  • [Everything MD] [Everything MD Water]ボタンを追加しました。同じく PDB / mol2 / sdf / mol ファイルを読み込んだときに、読み込んだ全分子系の分子動力学計算を、数回のクリックで、ほぼ全自動で完了させます。分子動力学計算の前には、Clean Geometryは必ず実行しますので、上記ボタンの機能を含むことになります。
  • マウス操作で、クリック1回で、原子1個を選択、クリック2回(ダブルクリック)で、残基1個を選択、クリック3回(トリプルクリック)で、チェイン1個を選択できるようになりました。