PDB 4lxz P3-L12-M7-W（タンパク質３、化合物１２、金属７、結晶水）
Structure of Human HDAC2 in complex with SAHA (vorinostat)
１．P3 すべてのタンパク質の末端処理 OK
２．P3 すべてのタンパク質のS-S結合付加 OK（S-S結合は存在しなかった）
３．金属以外のすべての分子の水素原子付加 OK
４．系全体のエネルギー極小化計算、分子動力学計算 OK
In silico drug design (molecular design) package software with myPresto and GROMACS. インシリコ創薬による、ドラッグデザイン（薬剤分子設計） パッケージ ソフトウェア
PDB
