MAC または Linux への GROMACS のインストール手順は、@Ag_smith(Yoshitaka Moriwaki)様のこちらのページが詳しいです。
https://qiita.com/Ag_smith/items/2432375399e7d7868138
MACの場合は、ターミナル上でbrewコマンドでインストールする方法が最も手軽です。
Intel版かApple Sillicon版かでインストール先が変わるのでそこだけ気にする必要があります。
以下手順
0) Homebrew インストール ※未インストールの場合。→ https://brew.sh/
ターミナルで実行
/bin/bash -c “$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)”
1) GROMACSインストール
ターミナルで実行
brew install gromacs
… 完了後、gmxコマンドが使用できるか確認
which gmx
/usr/local/bin/gmx (Intel版)
/opt/homebrew/bin/gmx (Apple Silicon版)
2) MolDeskのパス設定
Help -> Preference -> 1.Molecular dynamics
Molecular Dynamics Program: GROMACS
GROMACS directory: /usr/local (Intel版)
/opt/homebrew (Apple Silicon版)
↓
MD計算実行
