In silico drug design (molecular design) package software with myPresto. インシリコ創薬による、ドラッグデザイン(薬剤分子設計) パッケージ ソフトウェア

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MolDesk Basic 動画(古い版)

初正式リリース版の MolDesk Basic ver.1.0.0.0 機能説明

初正式リリース版の MolDesk Basic ver.1.0.0.0 の機能説明の動画です。

[Simple]全自動計算機能のご紹介 (MolDesk ver.0.3.1 β)

[Simple]機能として、ボタン一つで、ほぼ全自動で、入力した分子系の、Clean geometryやMD計算を、水溶媒のありなしで、実行できるようになりました。 その結果、molファイルや、PDBファイルにH原子など …

EGFR tyrosine kinase domain と修飾したerlotinibや、他の薬剤候補化合物をドッキング計算 (MolDesk ver.0.1.0 β)

EGFR tyrosine kinase domainに、修飾したerlotinibや、他の薬剤候補化合物を、MOPAC7による電荷付加や、構造最適化をしてから、ドッキング計算。(MolDesk ver.0.1.0 β) …

水分子の入ったフラーレン(C60)を作成してMD計算 (別の方法で作成) (MolDesk ver.0.1.0 β)

フラーレン(C60, fullerene)を作成して、その中に水分子を1個入れて、最後にMD計算を実行。(MolDesk ver.0.1.0 β) 前回は、C原子を60個追加していく方法で作成しましたが、今回は、シクロペ …

PDB 1m17 のタルセバ(エルロチニブ,erlotinib)をドッキング計算・編集・構造最適化 (MolDesk ver.0.0.1 β)

PDB 1m17 のPDBファイルをそのまま読み込み、不必要な部分を削除して、H原子を付加したのち、エネルギー最小化計算、MD計算、ドッキング計算、タルセバ(エルロチニブ,erlotinib)に芳香環を付加して、ポケット …

水分子の入ったフラーレン(C60)を作成してMD計算 (MolDesk ver.0.0.1 β)

フラーレン(C60, fullerene)を作成して、その中に水分子を1個入れて、最後にMD計算を実行。(MolDesk ver.0.0.1 β) YouTubeの設定で、画質を 自動(480p)—>7 …

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