In silico drug design (molecular design) package software with myPresto インシリコ創薬による、ドラッグデザイン(薬剤分子設計) パッケージ ソフトウェア

ライセンス

  • HOME »
  • ライセンス

価格

製品名 機能 ライセンス 価格
MolDesk Basic タンパク質・化合物2D/3D編集 /ドッキング計算 / 構造最適化 / MD計算 / 簡易ポケット探索 / 合成容易性 永年 + 1年保守 お問い合わせください
カタログ小
カタログ大
2年目以降の保守については別途契約が必要です。保守にはバージョンアップ、不具合対応が含まれます。 お問い合わせください
MolDesk Screening Basicのすべての機能 +
/ 薬剤スクリーニング / 高精度ポケット探索 / 部分構造検索 / 類似構造検索
1年 お問い合わせください
カタログ小
カタログ大
1年経過後の使用は契約の更新が必要です。

MolDesk Basic / MolDesk Screening の機能比較表

※ 試用版をご要望の場合は、お気軽にお問い合わせください。3か月有効な製品版をご提供いたします。あるいは、myPresto の最新版のダウンロードサイトでユーザ登録してからフリーで入手できる myPresto Portal をインストールしてお試しください。myPresto Portal は、MolDesk Basic の機能限定版です。

動作環境  [Basic][Screening]

OS Windows 10 / 8.1 / 8 / 7 / Vista
Windows Server 2012 R2 (AWS / さくらVPS)
Linux 64bit
macOS 10.11 以上
Java 実行環境 Windows : JRE 1.8 以上
Linux : 64bit JRE 1.8 以上
macOS : JDK 1.8 以上

※ Java eclipse で作成しているため、Java 環境が必要です。

※ Windows は、Java 環境が前もってインストールされているので、MolDesk のインストーラーを実行するだけでインストールできます。

※ macOS は、JRE でなく JDK 1.8 以上のインストールが必要です (Mac での JRE の不備により)。JDK はこちらのオラクルのサイトから入手できます。

※ 詳細なインストール方法は、MolDesk_Basic_ver.1.1_install(日本語)(英語) をご覧ください。

※ クラウド(Azure / AWS / さくらの VPS)で動かすこともできます。詳細はこちらをご覧ください。

動作環境 オプショナル  [Screening]

※ 以下は、MolDesk Screening で、MPI / CUDA (NVIDIA GPU) による 高速な MD 並列計算を実行したいときに必要です。(なくても MD 計算はできます。macOS は MPI / CUDA による並列 MD 計算はできません。)スクリーニング計算はスレッド並列なので、以下の環境がなくとも並列計算できます。

MPI 実行環境 Windows : MS-MPI
Linux : openmpi または mpich2 / mpich3
CUDA 実行環境 NVIDIA GPUボードと、そのグラフィックドライバがインストールされていること
※ MPI と CUDA 実行環境のインストール方法はこちらをご覧ください。

スクリーニング計算の注意事項  [Screening]

  1. Window 32bit では動作しません。スクリーニング計算を実行したいときは、Windows 64bit、Linux 64bit、または、macOS のなるべくスペックの良いマシンをご用意ください。
  2. 1回あたりの200万化合物のスクリーニング計算で、約5GB 記憶媒体を消費します。
  3. LigandBox を、インストール先のマシンにユーザがコピーする必要があります。LigandBox とは、スクリーニング対象の 200 万個の低分子化合物データベースのことで、最新版の LigandBox 2016 をご提供いたします。
  4. スクリーニング計算時に必要なメモリ量は、例えば、8並列で動作させる場合は、16 GBメモリです。48 並列の場合は、32 GBメモリ量が必要です。初期の並列数は、自動的に最大プロセッサ数になっていますが、メモリ量が少ないマシンでは、ユーザが並列数を減らして実行する必要があります。スクリーニング計算の並列数は、Preferenceの設定で簡単に変更できます。

カスタマイズ

ご要望がございましたら、カスタマイズにも対応できます。

販売実績

国立環境研究所、広島市立大学、千葉工業大学、国立感染症研究所、電気通信大学、東京工業大学、北海道大学、産業技術総合研究所、民間企業複数社

試用版はお気軽にお問い合わせ下さい (Please feel free to request a trial version)

  • Facebook
  • Hatena
  • twitter
  • Google+
PAGETOP
Copyright © 2015-2018 IMSBIO Co., Ltd. All Rights Reserved.